氣相色譜儀載氣由高壓鋼瓶中流出，經減壓閥降到所需壓力后，通過凈化干燥管使載氣凈化，再經穩壓閥和轉子流量計后，氣相色譜儀以穩定的壓力、恒定的速度流經氣化室與氣化的樣品混合，將樣品氣體代入色譜柱中進行分離。氣相色譜儀分離后的各組分隨著載氣先后流入檢測器，然后載氣放空。氣相色譜儀檢測器將物質的濃度或質量的變化轉變為一定的電信號，經放大后在記錄儀上記錄下來，就得到色譜流出曲線。根據氣相色譜儀色譜流出曲線上得到的每個峰的保留時間，可以進行定性分析，根據峰面積或峰高的大小，可以進行定量分析。
氣相色譜儀基線出現波浪狀峰的原因：
(1)高靈敏度操作氣相色譜儀未穩定之前;
(2)操作氣相色譜儀TCD、ECD時，柱箱或檢測器箱溫度周期變化;
(3)環境溫度對氣相色譜儀控溫影響;
(4)電壓不穩，對氣相色譜儀柱溫控制精度影響;
(5)過溫保護設置低于控制溫度;
(6)氣相色譜儀壓力(流量)調節閥失調，周期變化。
氣相色譜儀溫度控制不正常的原因分析:
A.所有溫度均不正常時，先檢查氣相色譜儀電網電壓及接地線是否正常。
B.所有溫度均不穩定時，可降低氣相色譜儀柱箱溫度，觀察進樣器和檢測器的溫度，如果正常，則是電網電壓或接地線引起的故障。
C.如果氣相色譜儀電網電壓和接地線正常，則通常是微機板故障，一般來說各路溫控的鉑電阻或加熱絲同時損壞的可能性極下。
D.如果是某一路溫控不正常，則檢查該路溫控的鉑電阻、加熱絲是否正常。
E.如果是柱箱溫控不正常，還要檢查氣相色譜儀相應的繼電器、可控硅是否正常。
F.如果鉑電阻、加熱絲等均正常，則是微機板故障。
G.在上述檢查過程中，要注意氣相色譜儀各零部件的接插件、連接線是否存在斷路、短路、以及接觸不良的現象。
